WATERLOO 1815 - 27 settembre - 8 novembre 2015 (Museo Civico Medievale)
Incanti di musica. I libri liturgici del Museo Civico Medievale. 19 settembre 2013 - 6 gennaio 2014 (Museo Civico Medievale)
Impressioni bizantine. Salonicco attraverso le immagini fotografiche e i disegni della British School at Athens (1888-1910), 12 aprile - 28 settembre 2014 (Museo Civico Medievale)
Fanti, Cavalieri e Re. I soldatini raccontano Bologna e il Medioevo, 3 ottobre - 9 novembre 2014 (Museo Civico Medievale)
Giovanni da Modena. Un pittore all'ombra di San Petronio, 12 dicembre 2014 - 12 aprile 2015
1143: la croce ritrovata di Santa Maria Maggiore a Bologna. 23 giugno 2017 - 7 gennaio 2018
Bologna 1116 Dalla Rocca imperiale alla città del Comune, 19 marzo -17 luglio 2016
Carlo Zauli. Le Zolle. 18 gennaio - 6 aprile 2015
Carlo Zauli. Terra provocata. Percezione della materia e concetto nella materia, 23 gennaio - 20 marzo 2016
Confronti di Bruno Raspanti. 7 maggio - 1 ottobre 2017
Contatti indicibili. 27 gennaio - 3 marzo 2024
Dante e la miniatura a Bologna al tempo di Oderisi da Gubbio e Franco Bolognese - 28 maggio 2021 - 9 gennaio 2022
Gli Assiri all'ombra delle Due Torri. Un mattone iscritto della ziggurat di Kalkhu in Iraq e gli scavi della Missione Archeologica Iracheno-Italiana a Ninive. 14 giugno - 17 settembre 2023
Il museo che non si vede. Tesori dai depositi del Museo Civico Medievale. 7 gennaio - 5 marzo 2023
Imago splendida. Capolavori di scultura lignea a Bologna dal Romanico al Duecento - 22 settembre 2019 - 6 settembre 2020
"Ex tempore. Soffitti e volte" Mostra fotografica di Antonio Cesari. 7 dicembre 2013 - 2 marzo 2014
"Il Michelangelo incognito" Alessandro Menganti e le arti a Bologna nell'età della Controriforma . 17 maggio- 1 settembre 2002
"Invincibili" Ottomani. Armi ed insegne turche nelle raccolte del Museo Civico Medievale. 20 aprile 2012 - 20 novembre 2013
"Le più belle maioliche" Capolavori di Colle-Ameno e Finck nella Bologna del Settecento. 26 novembre 2011 - 4 marzo 2012
1506: la cacciata dei Bentivoglio. 21 ottobre 2006 - 7 gennaio 2007
1609-2009. Annibale Carracci: due opere per un centenario. 19 settembre 2009 - 31 gennaio 2010
Alle origini dell'iconografia presepiale. 29 novembre 2008 - 1 febbraio 2009
Antichi tesori dalla Corea. 23 marzo - 24 maggio 2009
Duecento. Forme e colori del Medioevo a Bologna. 15 aprile - 16 luglio 2000
From Hand to Hand - Mostra di illustrazioni e dipinti, iniziativa di solidarietà per il Giappone . 20 marzo - 24 marzo 2012
Giotto e le arti a Bologna al tempo di Bertrando del Poggetto. 3 dicembre 2005 - 28 marzo 2006
Giovanni Battista Cavalletto Un miniatore bolognese nell'età di Aspertini. 8 novembre 2008 - 22 febbraio 2009
I Corali benedettini di San Sisto a Piacenza. 21 settembre -2 dicembre 2012
Jacopo Valentini Concerning Dante - Autonomous Cell 12 maggio - 2 ottobre 2022
JAZZ Matisse. Un libro d'artista della collezione Mingardi. 21 settembre - 21 ottobre 2012
Kinku. Sigilli dell'età del bronzo dalla regione di Gaziantep in Turchia. 29 aprile - 4 settembre 2011
L'allegoria del Sonno di Alessandro Algardi dalla Galleria Borghese di Roma. 3 marzo - 10 giugno 2018
La basilica incompiuta. Progetti antichi per la facciata di San Petronio a Bologna. 4 ottobre 2001- 6 gennaio 2002
La cattedrale scolpita Il romanico in San Pietro a Bologna. 13 dicembre 2003 - 12 aprile 2004
La croce dipinta di Marco Zoppo e la cultura pierfrancescana a Bologna. Ospiti 19. 7 dicembre 2007 - 16 marzo 2008
La forza del colore di Jean François Migno. 17 maggio-8 settembre 2019
La lapide Duglioli Yoav da Rieti: una ricostruzione virtuale. 18 ottobre-11 novembre 2007
Le ceramiche che non si vedono. Capolavori rinascimentali del Museo Civico Medievale. 9 maggio - 23 settembre 2007
Le Madonne di Vitale. Pittura e devozione a Bologna nel Trecento. 20 novembre 2010 - 20 febbraio 2011
Le pagine dipinte Capolavori della miniatura bolognese del Medioevo e del Rinascimento. 16 settembre 2004 - 9 gennaio 2005
Le stanze le opere. 24 ottobre 2020 - 28 febbraio 2021
Lippo di Dalmasio e le arti a Bologna tra Trecento e Quattrocento. 18 novembre 2023 - 17 marzo 2024
Lithuanian Illustration Exhibition Giovani Illustratori lituani llustrazioni di Evelina Paukštyte, Karolis Strautniekas. 29 marzo - 10 aprile 2011
Lodi per ogni ora. I corali francescani provenienti dalla Basilica di San Francesco, 16 settembre 2018 - 16 giugno 2019
Martino Genchi. Raccogli la cosa nell'occhio. 27 gennaio - 26 marzo 2017
Medioevo svelato. Storie dell'Emilia-Romagna attraverso l'archeologia. 17 febbraio - 17 giugno 2018
Memoires d'Egypte... da un album fotografico del 1895 Foto di Beato, Bonfils, Lekegian, Reiser. 16 settembre - 7 novembre 2010
Musée de l'OHM Opening Here Museum presenta. Mostra personale di Chiara Pergola. 17 ottobre 2009 - 7 febbraio 2010
Non siamo mai stati oggetti. 18 aprile - 14 maggio 2023
Ospiti tedeschi, 5 giugno - 30 settembre 2018
Pirro Cuniberti diari dipinti e libri d'autore realizzati giorno dopo giorno. 15 settembre - 30 ottobre 2011
Risonanze - 23 ottobre 2021 - 9 gennaio 2022
San Domenico: il volto del Santo nei codici miniati del Museo Civico Medievale 1216-2016. 1 dicembre 2016 - 11 giugno 2017
Sete fruscianti, sete dipinte. Il recupero della collezione tessile del Museo Civico Medievale. 24 maggio- 29 settembre 2013
Soldatini in marcia Verso l'Unità d'Italia. 4 marzo - 20 marzo 2011
Sorores in choro. I libri corali delle Domenicane bolognesi. 13 aprile - 28 settembre 2008
STIGM?TA. La tradizione del tatuaggio in Italia - 29 marzo - 30 aprile 2017
Strumenti a fiato in legno dalle collezioni private italiane. 19 maggio - 1 luglio 2001
Tesori tra le pagine I libri miniati del Museo Civico Medievale. 6 luglio 2010- 9 gennaio 2011
Token L'arte della spada giapponese. 4 febbraio-1 aprile 2001
Tra la Vita e la Morte. Due confraternite bolognesi tra Medioevo e Età Moderna, 12 dicembre 2015 - 28 marzo 2016
Traces - 23 gennaio - 5 luglio 2020
Tullio Pericoli. Un libro fatto a mano "Storie della mia matita". 25 settembre - 29 novembre 2015
Vestire una storia I costumi di Nanà Cecchi per "Christine Cristina". 2 dicembre 2009 - 31 gennaio 2010
Vetri. Dal Rinascimento all'Ottocento. La donazione Cappagli Serretti per i Musei Civici d'Arte Antica di Bologna. 13 novembre 2021-25 settembre 2022